假设有文件test.txt,想把test.txt文件第三列含有的good替换为bye,并把替换后的文件保存为test_bye.txt,只需要如下命令. test.txt go go good go my my go good bye my good bye test_bye.txt go go bye go my my go good bye my bye bye awk -F " " '{if ($3==good) $3=bye}1' test.txt > test_bye.t
假设有文件长如下样子: CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT samplename 1 3552841 . G . 32.995 . DP=1;MQ0F=0;AF1=0;AC1=0;DP4=1,0,0,0;MQ=40;FQ=-29.9912 GT:PL:DP 0/0:0:1 1 3552842 . T . 32.995 . DP=1;MQ0F=0;AF1=0;AC1=0;DP4=1,0,0,0
存在file1.txt,其内容如下: H aa 0 0 1 -9 H bb 0 0 2 -9 H cc 0 0 2 -9 存在file2.txt,其内容如下: H aa 0 0 0 -9 asd qwe H bb 0 0 0 -9 fgh rty H cc 0 0 0 -9 jkl uio 现希望根据file1和file2相同的列字符合并文件,要求如下:1.如果两个文件的第二列相同,则将file2的第三列.第四列.第五列.第六列修改为file1对应的第三列.第四列.第五列.第六列内容:2.新文件